Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn22Q9D7U6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn22Q9D7U6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms