Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmigd1Q9D7L8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms