Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf13Q9D777 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf13Q9D777 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms