Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc39Q9D5Y1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc39Q9D5Y1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms