Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lonrf3Q9D4H7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lonrf3Q9D4H7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms