Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Odf2lQ9D478 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Odf2lQ9D478 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms