Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms