Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4933428M09RikQ9D3X3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms