Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rsph14Q9D3W1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rsph14Q9D3W1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms