Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D3J9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9D3J9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms