Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf146Q9CZW6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms