Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Acsl3Q9CZW4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Acsl3Q9CZW4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms