Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Shisa9Q9CZN4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shisa9Q9CZN4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms