Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snf8Q9CZ28 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snf8Q9CZ28 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snf8Q9CZ28 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Snf8Q9CZ28 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Snf8Q9CZ28 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snf8Q9CZ28 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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