Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Prdm5Q9CXE0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm5Q9CXE0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm5Q9CXE0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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