Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tdrd12Q9CWU0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tdrd12Q9CWU0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms