Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gnpda2Q9CRC9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gnpda2Q9CRC9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms