Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl28Q9CR40 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms