Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp5f1Q9CQQ7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atp5f1Q9CQQ7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms