Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim8Q9CQQ0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms