Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc5Q9CQA1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trappc5Q9CQA1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc5Q9CQA1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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