Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pole4Q9CQ36 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pole4Q9CQ36 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms