Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms