Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brms1Q99N20 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brms1Q99N20 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms