Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkd1Q99MH6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd1Q99MH6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms