Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp4Q99ME9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms