Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chmp1b1Q99LU0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms