Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf34Q99KR6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rnf34Q99KR6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms