Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Def8Q99J78 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms