Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Thumpd1Q99J36 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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