Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ophn1Q99J31 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ophn1Q99J31 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms