Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf112Q96DY5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms