Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spdl1Q923A2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spdl1Q923A2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms