Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tubb6Q922F4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tubb6Q922F4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms