Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TardbpQ921F2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TardbpQ921F2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms