Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx4Q91YJ2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms