Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atl3Q91YH5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atl3Q91YH5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms