Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam20bQ8VCS3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam20bQ8VCS3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms