Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCM8

Ncln, Nicalin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclnQ8VCM8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NclnQ8VCM8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NclnQ8VCM8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NclnQ8VCM8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NclnQ8VCM8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NclnQ8VCM8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NclnQ8VCM8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NclnQ8VCM8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NclnQ8VCM8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NclnQ8VCM8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms