Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpsap2Q8R574 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpsap2Q8R574 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms