Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sf3b4Q8QZY9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sf3b4Q8QZY9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms