Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fndc5Q8K4Z2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc5Q8K4Z2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc5Q8K4Z2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc5Q8K4Z2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc5Q8K4Z2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc5Q8K4Z2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fndc5Q8K4Z2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc5Q8K4Z2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc5Q8K4Z2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fndc5Q8K4Z2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms