Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnot6Q8K3P5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnot6Q8K3P5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms