Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OptnQ8K3K8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OptnQ8K3K8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OptnQ8K3K8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms