Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Vrk3Q8K3G5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vrk3Q8K3G5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Vrk3Q8K3G5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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