Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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Trappc12Q8K2L8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Trappc12Q8K2L8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Trappc12Q8K2L8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Trappc12Q8K2L8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Trappc12Q8K2L8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Trappc12Q8K2L8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc12Q8K2L8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms