Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Fbxo18Q8K2I9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fbxo18Q8K2I9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Fbxo18Q8K2I9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Fbxo18Q8K2I9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Fbxo18Q8K2I9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Fbxo18Q8K2I9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Fbxo18Q8K2I9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Fbxo18Q8K2I9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fbxo18Q8K2I9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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