Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hacd3Q8K2C9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hacd3Q8K2C9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms