Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Alkbh3Q8K1E6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms