Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc73Q8CDM4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms